有勁的基因資訊

作者：謝維馨/有勁生物科技

什麼是決策樹 (Decision Tree)

決策樹(Decision Tree)是常見的資料探勘(Data Mining)技術，主要是使用樹狀分枝的概念來作為決策模式，是一種強大且廣受歡迎的分析方法。

作者：郭任超/ 有勁生物科技

泛自閉症障礙 (autism spectrum disorder, ASD) 是一種發生於兒童發育早期的神經障礙性疾病，相當多變而複雜，主要表徵包括：社會互動能力下降、語言障礙、刻板、重複性動作與行為、興趣狹窄等。

作者：邱佩洵 /有勁生物科技

你可曾想過，口渴的時候，不是拿起一瓶礦泉水來喝，而是拿出晶片在太陽底下一照，就有乾淨美味可口的水可以喝；是否想過，小小的人造葉片，能夠透過催化劑分解水分子產生氫、氧元素，提供能源。如果這些真的在未來發生，世界會變成怎樣？

作者：金漢強/有勁生物科技

從去年年底BBC記者報導中國「天網」監控系統測試的新聞¹開始，有關「監控」的報導三不五時就會出現；大數據監控的影響力顯然無遠弗屆。關於監控，以人權論，台灣或許真的較進步；不過從累積大數據的角度來說，中國無疑地正以不可思議的速度在成長，這當中也包括了基因數據的積累。儘管有報導指出中國的數據採集過程有各種爭議，但是數據庫的快速增長也是不爭的事實²。

作者：蘇蕭咨/有勁生物科技

肝苦誰人知？腸道菌的族群變化或許可以提供線索，幫我們找到答案。

作者：王育彬/有勁生物科技

資料圖形化(data visualization)是資料統計過程的重要元素，資料要經過適當的圖形化處理，大家才容易找出及理解資料背後所蘊藏的秘密；科學的研究領域中，資料圖形化更是呈現實驗數據的重要工具。論文內容裡，從簡單的長條圖、折線圖，到複雜的樹狀圖及網路圖，各種圖的應用都扮演重要的角色，再加上清楚的圖說，讀者就能簡單地消化研究數據所要傳達的概念。heatmap (熱圖)便是基因研究領域中大量被採用的一種資料圖形化工具。

有勁除了有官網與部落格外，也有臉書的粉絲專業囉！  有勁粉絲團的內容會比較多元，包括：部落格文章分享、節慶暖語、趣味影片及時事新聞…等等，發文時間為週二與週四，另外，分享部落格文章的同時，粉絲團的小編也會概略敘述文章的重點，於此附上有勁粉絲團的連結請按此。 也可透過其他方法進入有勁臉書的粉絲專業，方法如下：

一、直接在瀏覽器的搜尋欄輸入「有勁生物科技」(見圖一的籃框)，即可看到粉專囉！(見圖一的紅框)

作者：伊喬伶/有勁生物科技

有別於傳統Sanger定序，次世代定序(NGS)因其大量平行、高通量的定序技術，不僅讓效率提升，人類基因體的定序成本也從1,000萬美元降至1,000塊美元；隨著科技日異月新，未來甚至可望降至100塊美元。¹

作者：徐銘鴻/有勁生物科技

在科技越來越發達的現今，資訊業和金融業都在強調大數據分析；生物技術產業當然也不會放過這個機會，力圖將大數據分析結合醫療行為，開創出「個人化醫療」的未來新方向。

作者：鄭翰欽/有勁生物科技

由Pacific Biosciences公司(簡稱PacBio)所建立的第三代定序技術─Single Molecule Real Time (SMRT) (相關技術原理可參考有勁2013/11/21部落格文章)，其reads長度普遍都能超過10KB，因此可以跨過一些基因體(Genome)上的重複序列，讓組裝(Assembly)過程更容易。然而SMRT定序過程中，直接對單一DNA分子進行定序的話，錯誤率會偏高；若在此過程中使用SMRTbell template對同一條序列進行重複定序，並將這些重複的序列整合成Circular consensus sequencing (CCS) reads，就可將定序錯誤率壓到很低。於是現在愈來愈多人會利用SMRT定序技術去進行基因體定序及後續的組裝。然而，使用SMRT定序所得到的reads為HDF5格式，而非常見的fastq格式，想直接拿SMRT reads結果做分析會很不方便。因此，在這裡要介紹PacBio官方出版的分析軟體─SMRT link給大家參考。

作者：林佑軒/有勁生物科技

日常生活中，我們去金飾店購買以重量計價的金飾時，要如何確認同一金飾在不同店家其秤重結果會一樣？店家的電子秤通常都已經過砝碼校正確認，而這些砝碼本身也都校正過並確認對應符合國際度量衡局的標準重量，所以使用經砝碼校正後的電子秤，不論何處買的金飾，店家皆應能提供公正的重量及售價。在NGS應用領域中，是否也有類似砝碼那樣的校準物可參考呢?