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比較不同實驗條件下生物體的基因表現量差異,不再只能透過生物晶片觀察螢光反應定量基因表現量,亦可以藉由次世代定序偵測生物體的基因表現 (圖一) (Garber M, 2011)。而從RNA-seq結果尋找具有顯著表現量差異的基因是分析定序資料很重要的一部份,想要精確地定量和正規化定序資料,至少需要考慮兩個因素:基因長度和定序深度(或是總定序資料量)

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定序的技術不僅讓英國科學家 Frederick Sanger 於諾貝爾化學獎梅開二度外,亦深深奠定往後次代定序 (Next- generation sequencing, NGS) 的基礎,此項技術將生物、化學與電腦運算三者整合為一,徹底改變多樣化的基因組應用,更帶來劃時代進展,其目的無非是將生物體內大量的有字天書作趨近於完美的詮釋。為了因應大量序列數據的辨認,因此發展出條碼系統(Barcode system),拜此辨識概念的引入,即允許混合多數樣品並於同時間進行大量定序(Bystrykh, 2012),本文主要探討條碼對於次代定序的貢獻,從日常生活的有形化乃至生技層面的無形化,比比皆是,隨處可尋條碼的蹤跡,可見其對於人類生活息息相關,以下分三部分做詳細介紹:

壹、日常生活應用

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非洲裸鼠 (Naked mole rat) 學名:Heterocephalus glaber 是一群在東非地底底棲生活,大小約 8-10 cm,重約 30-35 g 的鼠輩,牠們擁有一般地底生物常見特性,例如:耐熱、耐 CO2、視力不佳、能敏銳感受震動,牠們進行鼠類中少見的團體生活,並且具有哺乳類動物中唯二的真社會化系統 (Eusociality),只有女王鼠能與少部份雄鼠繁衍後代。

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