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近年來,應用NGS定序技術於RNA層面的研究,給予科學家全面性分析及定量生物體中的不同類型的RNA (例如:mRNA, long non-coding RNA, miRNA, rRNA..等)。進而讓我們更了解基因型 (Genotype)及表現型 (Phenotype)之間的關聯性。Monika Stefaniuk在2015年回顧了近幾年多個團隊使用RNA-Seq分析的研究成果,主要可分為三個面向,(1) Gene expression profiling (馬的基因表現譜);(2) Physiological state (馬的生理狀態) ;(3) Hereditary diseases (馬的遺傳疾病)

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有人透過生物電阻分析儀器估算身體年齡,也有人可以透過膚質檢測計了解肌膚的狀態,目的都是要了解老化的情形,並了解自己是否保養得宜,更重要的是從古迄今,人們害怕變老、害怕死亡及好奇壽命的長短。科學家抽絲剝繭深入的探索並揭露生命的秘密,影響老化的機制,可能包括了DNA本身衰老 (senescence)、端粒縮短 (telomere shortening)、基因表現改變等等。基因外修飾被視為影響基因表現的重要角色,基因外修飾的特點是不會改變DNA本身之序列,而是透過DNA甲基化、histone acetylation等方式,去影響基因的表現。

DNA甲基化在基因體上的總量以及在特定的某些位點的變異程度,會隨著生命週期的發展而有所改變。在新生兒血液中,發現DNA甲基化的量低於各個生命期並在出生後的第一年,DNA甲基化才會開始增加。而增加的位置通常發生在CpG island shores and shelves、enhancers、promoters lacking CpG islands。兒童及青少年的相關研究較少,因此DNA甲基化程度,仍不是很清楚。在成人期則在血液及腦部中,發現DNA甲基化快速增加並且穩定下來,且隨著年紀增加,個體差異會越來越大。成人後期,血中DNA甲基化程度會隨著老化的增加而降低,然而,更深入分析時則發現,原先甲基化較低的區域,如與啟動子(promotor)有關的CpG islands,會隨著老化而增加DNA甲基化,相反的,原先有較高甲基化的區域,如intergenic nonisland CpGs 則是傾向失去甲基。

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次世代序列定序 (NGS)已被廣泛應用於各種疾病的研究,藉由尋找疾病特有的變異特性了解生物機轉改變的原因,進而應用於精準的醫學檢測及個人化醫療的可能性 (以癌症為例,可參考Oncomine 精準醫學在癌症領域的應用)。 台灣團隊 [1]於2016年發表於Journal of Molecular Medicine探討卵巢內的異位性子宮內膜所造成的卵巢癌為例,研究該疾病在台灣患者DNA發生變異的情況及屬於該疾病之個體變異。

前情提要:

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衛福部於2015年6月發表103年十大死因以慢性疾病為主,死亡率依序為(1)惡性腫瘤(2)心臟疾病(3)腦血管疾病(4)肺炎(5)糖尿病(6)事故傷害(7)慢性下呼吸道疾病(8)高血壓性疾病(9)慢性肝病及肝硬化(10)腎炎、腎病症候群及腎病變。

若以年齡觀察,1至24歲死因以事故傷害居首位;25至44歲死因以惡性腫瘤、事故傷害居前二位;45歲以上死因屬慢性疾病之惡性腫瘤、心臟疾病居前二位。65歲以上死亡者占69.8%,以惡性腫瘤居首位,經上述資料得知老化與癌症也許是有極度相關。

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