目前日期文章:201801 (5)

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作者:王育彬/有勁生物科技

 

資料圖形化(data visualization)是資料統計過程的重要元素,資料要經過適當的圖形化處理,大家才容易找出及理解資料背後所蘊藏的秘密;科學的研究領域中,資料圖形化更是呈現實驗數據的重要工具。論文內容裡,從簡單的長條圖、折線圖,到複雜的樹狀圖及網路圖,各種圖的應用都扮演重要的角色,再加上清楚的圖說,讀者就能簡單地消化研究數據所要傳達的概念。heatmap (熱圖)便是基因研究領域中大量被採用的一種資料圖形化工具。

 

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作者:伊喬伶/有勁生物科技

 

有別於傳統Sanger定序,次世代定序(NGS)因其大量平行、高通量的定序技術,不僅讓效率提升,人類基因體的定序成本也從1,000萬美元降至1,000塊美元;隨著科技日異月新,未來甚至可望降至100塊美元。1

 

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作者:徐銘鴻/有勁生物科技

 

在科技越來越發達的現今,資訊業和金融業都在強調大數據分析;生物技術產業當然也不會放過這個機會,力圖將大數據分析結合醫療行為,開創出「個人化醫療」的未來新方向。

 

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作者:鄭翰欽/有勁生物科技

 

由Pacific Biosciences公司(簡稱PacBio)所建立的第三代定序技術─Single Molecule Real Time (SMRT) (相關技術原理可參考有勁2013/11/21部落格文章),其reads長度普遍都能超過10KB,因此可以跨過一些基因體(Genome)上的重複序列,讓組裝(Assembly)過程更容易。然而SMRT定序過程中,直接對單一DNA分子進行定序的話,錯誤率會偏高;若在此過程中使用SMRTbell template對同一條序列進行重複定序,並將這些重複的序列整合成Circular consensus sequencing (CCS) reads,就可將定序錯誤率壓到很低。於是現在愈來愈多人會利用SMRT定序技術去進行基因體定序及後續的組裝。然而,使用SMRT定序所得到的reads為HDF5格式,而非常見的fastq格式,想直接拿SMRT reads結果做分析會很不方便。因此,在這裡要介紹PacBio官方出版的分析軟體─SMRT link給大家參考。

 

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