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作者:徐嘉妤/有勁生物科技

 

小時候,爸爸媽媽或阿公阿嬤都會叫你多吃蔬菜,說吃蔬菜對身體好,比較健康。但是蔬菜到底是好在哪裡呢?是富含膳食纖維?還是可以改善我們腸道的益生菌?最近《Immunity》期刊有一篇研究或許可以給大家一個更好的解釋1

 

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作者:王育彬/有勁生物科技

 

NGS次世代定序以及大量定序資料與生物資訊演算法的發展,讓我們得以更瞭解人類細胞的遺傳訊息,研究學者也因此能透過相關定序應用去預測並解決人類的健康問題⼀特別是現今備受關切的癌症問題。然而,光是藉由探索分子訊息去瞭解與改善疾病其實還不夠,研究「外在環境因子如何影響生理而致病」同樣很重要。

 

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作者:何胤嫻/有勁生物科技

 

癌症是人類常見的死亡原因之一。為了治療癌症,人類對於手術、放射線、化療或是免疫療法等各類方法的研究嘗試,至今未曾中斷。早在十幾年前即有學者指出:當致癌蛋白(例如: MYC)大量表現時,腫瘤抑制蛋白(例如: p53)的表現就會被抑制,以致細胞因為受損的DNA無法修復而發展為腫瘤細胞。近年來更有研究發現,正常生物時鐘節律一旦受到干擾或被破壞,就會影響細胞週期中的基因調控表現,那些失去控制的腫瘤細胞因此得以持續增加1

 

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作者:徐銘鴻/有勁生物科技

 

  現今社會中的智能3C商品俯拾皆是;這些商品藉由許多不同的程式來滿足人類的各種需求。然而萬一程式突然發生錯誤,帶來的問題或傷害會有多嚴重?為了避免發生狀況,各國制訂了許多的規範,以防止因商品突然故障而造成遺憾。

 

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作者:鄭翰欽/有勁生物科技

 

  Immune repertoire(免疫細胞組譜;免疫細胞庫)是指什麼?簡單來說就是人體內B細胞或T細胞上抗原辨識受體(antigen receptor)種類與數量的綜觀。至於為何要研究immune repertoire?以及immune repertoire有哪些應用?本文先以T細胞為例,從T細胞發育開始介紹。

 

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作者:吳上豪/有勁生物科技

 

數月前筆者曾撰文介紹Illumina現行HiSeq 3000/4000/X Ten平台所使用的patterned flow cell(詳見有勁部落格文章:Illumina Patterned Flow Cell簡介),其藉由「固定孔洞」這個設計,讓基因文庫(gene library)能在flow cell上均勻且有效率地擴增,提高了定序資料量與儀器訊號判讀的能力。然而,由於筆者曾在HiSeq4000平台體驗過定序出現品質低落或資料量不足的經驗,所以在此想將使用patterned flow cell平台定序時所需注意的事項介紹給大家。

 

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作者:李覺白/有勁生物科技

 

  資料探勘(Data mining)是透過自動(由演算法自行完成探勘,不需人工介入)或半自動(探勘時仍需依賴人為介入過往處理資料的經驗判斷)的方式,從資料集(dataset)當中探索發掘有意義的資訊或模式的電腦科學,這裡的「模式」指的是「可重複出現的現象」,因此,也可以把資料探勘想成是一門從資料中探索知識的學科。資料探勘也是一門跨領域的學科,其包含了機器學習(machine learning)、人工智能(Artificial Intelligence)、模式辨別(Pattern cognition)、統計學(statistics)及資料庫系統(database systems)等等不同範疇(圖一)。

 

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作者:洪郁豪/有勁生物科技

 

    Illumina公司靠著Reversible Terminator–Based Sequence by Synthesis (SBS)這個專利系統技術,每年推陳出新許多不同的次世代定序平台。這套原由劍橋大學科學家Shankar Balasubramanian博士與David Klenerman博士所研究開發的系統,在2006年推出第一代定序儀Solexa -Genome Analyzer後隔年便為Illumina收購。這套定序系統實際上囊括了許多特別的技術(詳見下方影片一的官方3D模擬影片),而將其中各項技術成功組合起來,才是Illumina技術得以在定序市場佔有龍頭地位的主因1

 

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作者:劉祥欽/有勁生物科技

 

  血漿中游離DNA (circulating cell-free DNA) 的特性及來源漸為人們熟知後,其在檢測監控上的應用於近幾年不斷地被開發出來。「每個人血液中都有自己的游離DNA」已然成為老生常談;但「孕婦、癌症病患以及器官移植接受者血液中帶有胎兒、癌細胞或被移植器官的DNA」這個事實,可就讓研究者大大睜亮眼睛了。而以此為研究基礎,至今也已研究發展出非侵入性產前檢測 (NIPT)、癌細胞液態檢體 (liquid biopsy)與移植器官的監控與損害評估等技術。

 

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作者:陳崇斌/有勁生物科技

 

  實現精準醫療的第一步是精準診斷,亦即,要正確的診斷出病因,才能對「症」下藥。

 

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