(一)Illumina (Genome Analyzer)Sanger sequencing在定序前製作library過程中,是有極大差異的,最明顯的差異莫過於否需經過細菌進行質體複製。

前者(Illumina System就是指NGS)在製作library完全不需經過細菌進行質體複製就能直接進行定序,以減少錯誤發生率(如圖一)

新圖片.png  

而後者Sanger sequencing則是在製作過程中一定需經過細菌進行質體複製才能進行定序(如圖二)

新圖片 (1).png  


(二)Illumina (Genome Analyzer)Sanger sequencing可定序長度及同時能讀出的序列是有明顯落差(如下表)


Method
Read length(base pairs)
Templates per run

Illumine (Genome Analyzer)

250-300

1lane2500reads

Sanger sequencing

900

96reads



由上表得知,雖然Sanger sequencing一次定序長度相較於Illumina (Genome Analyzer)長,但是總輸出量卻比Illumina (Genome Analyzer)少,原因是因為Illumina (Genome Analyzer)的一片flow cell共有8lane,而1lane約可讀出2500reads,所總輸出量為2億。


綜合以上所有的原因可以歸納出Illumina (Genome Analyzer)之優勢:

  1. 不需經過細菌進行質體複製,減少錯誤發生率。
  2. 快速且高通量。

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YourGene 發表在 痞客邦 PIXNET 留言(3) 人氣()


留言列表 (3)

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  • YourGene
  • 另外,有網友問到"為什麼genome analyzer定序不用transformation 而傳統定序需要",這是因為genome analyzer是可以一次同時定序不同序列的DNA,而傳統定序只能一次定序一個片段,所以傳統定序必須先經過transformation把特定的片段clone出來再分別一段一段去定序,而genome analyzer是不用經過transformation。
  • 訪客
  • 想請問這篇圖的出處,是否能用於教學,謝謝~
  • 你好,部落格中的圖片是由本公司同仁所繪製,歡迎使用於教學上,但需註明來源為本部落格。

    YourGene 於 2014/06/11 16:43 回覆

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