有勁的基因資訊

前列腺癌是美國癌症比例第二高的癌症，然而，前列腺癌細胞內發生的基因變異卻尚未被完全了解。直到近年次世代定序技術的蓬勃發展，科學家才得以解序癌細胞內的全基因體序列，進而深入探討前列腺癌細胞的癌化機制。

        Michael F. Berger等人在2011年二月發表在知名期刊nature的”The genomic complexity of primary human prostate cancer”，其研究團隊以次世代定序平台GA2x解序七位罹患初期前列腺癌病患的癌細胞全基因體序列，研究發現前列腺癌細胞基因體有非常複雜的重組現象，如下圖，例如染色體21內，原本只會出現在紅色區域內的DNA序列卻出現在橘色區域中，而橘色區域的DNA片段也有轉移到紅色區域的情形，除此之外，不同染色體上的DNA片段也有相互交換的情形，例如正常細胞中僅會出現在第21對染色體之橘色區域的DNA序列，在癌細胞中出現在第1對染色體的黃色區域內。另外，下圖也顯示了在正常前列腺細胞內的基因體結構並沒有DNA片段位置轉移的現象。這些結果顯示前列腺癌細胞的基因體內，有著非常高頻率且複雜的重組現象(genomic rearrangements)，並且這些重組現象與癌化過程有很大的相關性。
 

癌細胞內發生的重組中，產生的斷點若發生在具有重要功能的基因區域，便會導致基因失去功能，或是產生不具正常生理功能的融合基因。下圖顯示重組產生的斷點發生在許多與癌化基因有關的區域，值得一提的是，在抑癌基因(tumour suppressor gene)的PTEN及與PTEN抑制癌症有關的MAGI2中，存在因為重組而產生的斷點。

藉由對於癌細胞的全基因體定序，科學家能從中找到與癌化有關的重要基因，並且輔以其他的實驗方法驗證，對於了解癌症分子特性及癌症的臨床治療都會有非常大的幫助。

資料來源: Berger MF et al. The genomic complexity of primary human prostate cancer. Nature. 2011 Feb 10;470(7333):214-20.