Gene Ontology簡介 @ 有勁的基因資訊

隨著越來越多的基因體被定序，如何有系統地且大規模的收集和整理基因的功能和所在的生物路徑，顯得越來越重要。例如，可以透過Enzyme Commission number(EC number)得以了解酵素的分類和所催化的化學反應。在生物資訊領域，Gene Ontology (簡稱為GO)常用來協助了解一群感興趣的基因產物。

Gene Ontology是由Gene Ontology Consortium於1998年所發起的計畫，主要目標為訂定對於所有基因功能之分類標準，起初整合了三個模式生物的資料庫，分別為FlyBase (果蠅)、Saccharomyces Genome Database (酵母菌)和the Mouse Genome Database (小鼠)，現在已經GO的範圍已經涵蓋到原核生物和其他真核生物。

GO資料庫主要包含三個分支：

生物途徑(Biological process)：指基因產物所參與的生物路徑
細胞組件(Cellular component)：指基因產物在細胞內外的位置
分子功能(Molecular function)：指基因產物的分子活性

以在KEGG pathway database中的細菌RNA聚合酶II (RNA polymerase II)為例，RNA聚合酶II包含五個亞基(α、β、β’、γ、δ和ω)，它們共同被註解在Cellular Component底下的DNA-directed RNA polymerase complex (GO term為GO:0000428)，如下圖所示。