有勁的基因資訊

Fusion gene 從基因體或轉錄體來講,是2個分開的基因的成為1個混合基因(hybride gene)。在生物資訊分析上，若只做map到Reference genome，

生物資訊參數有時會設為90%相似性，即定序長度100bases情況下,有90bases以上核甘酸序列是一樣的，就可map到Reference genome,因此就只能看小片段的 Insertion/deletion。

有些研究，是想看virus genome插在chromosome哪個位置，此需要用fusion gene生物資訊分析方式。首先，要將reads map到Reference genome後，因有些reads與Reference genome相似性低，無法將Map上，就會產生unmapped reads。如下圖： 

之後，將每條定序長度100base的unmapped reads切成2段，25bases及75bases；26bases及74bases；27bases及73bases；……直到75bases到25base等51種組合片段。然後，將這些每種組合片段分別map至Reference genome及Virus genome，從 map的位置，推估insertion至Reference genome的那個位置。以下是一條定序長度為100base的read的51種組合片段示意圖：

如Virus基因插在Reference chrosome1的position1000位置,我們將每條reads的51組合片段，分別map至Reference genome及TDNA，不可能每種組合都會map上，最後也許會找到一種組合可map至Reference Chrosome1及Virus genome.

就可知道map位置，找到Virus genome插到至染色體的位置。

最後，我們會推論出Pseudo sequence reference，並且將完整的100bases的unmapped reads map到Pseudo sequence reference，以確定此推論的正確性。