(一)Illumina (Genome Analyzer)與Sanger sequencing在定序前製作library過程中，是有極大差異的，最明顯的差異莫過於否需經過細菌進行質體複製。
前者(Illumina System就是指NGS)在製作library是完全不需經過細菌進行質體複製就能直接進行定序，以減少錯誤發生率(如圖一)。
而後者Sanger sequencing則是在製作過程中一定需經過細菌進行質體複製才能進行定序(如圖二)。
(二)Illumina (Genome Analyzer)與Sanger sequencing可定序長度及同時能讀出的序列是有明顯落差(如下表)。
Illumine (Genome Analyzer) 約250-300 1條lane約2500萬reads 約900 約96reads
Method
Read
length(base pairs)
Templates
per run
Sanger sequencing
由上表得知，雖然Sanger sequencing一次定序長度相較於Illumina (Genome Analyzer)長，但是總輸出量卻比Illumina (Genome Analyzer)少，原因是因為Illumina (Genome Analyzer)的一片flow cell共有8條lane，而1條lane約可讀出2500萬reads，所總輸出量為2億。
綜合以上所有的原因可以歸納出Illumina (Genome Analyzer)之優勢：
- 不需經過細菌進行質體複製，減少錯誤發生率。
- 快速且高通量。
文章標籤
全站熱搜
最近有網友寫信來詢問這篇文章的參考資料，所以在這裡貼出參考資料出處，方便有興趣的朋友參閱。 參考資料: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/18576944
另外，有網友問到"為什麼genome analyzer定序不用transformation 而傳統定序需要"，這是因為genome analyzer是可以一次同時定序不同序列的DNA，而傳統定序只能一次定序一個片段，所以傳統定序必須先經過transformation把特定的片段clone出來再分別一段一段去定序，而genome analyzer是不用經過transformation。
想請問這篇圖的出處，是否能用於教學，謝謝~
你好，部落格中的圖片是由本公司同仁所繪製，歡迎使用於教學上，但需註明來源為本部落格。