map_20141103  

  Address: 238 新北市樹林區復興路376-5號 (瀏覽照片公司內部實景)

TEL: (02)2675-8068  

FAX: 2675-1657

文章標籤

Yourgene Health 發表在 痞客邦 留言(0) 人氣()

作者:張家豪/有勁基因

 

有勁部落格文章《Illumina 平台上的「標籤跳躍」現象》中曾提到,NovaSeq™6000在兩天內就能量產出高達2 Tb的定序資料。為了節省成本會將多個樣品基因庫(library)混和定序,定序完成後會再經過一道「多工解訊(demultiplexing)」的步驟,將混和的樣品根據標籤(Index)分離出來。但是,萬一遇到未曾進行多工解訊處理的定序資料,該怎麼辦呢?這裡就以實際案例來跟讀者作個介紹。

 

文章標籤

Yourgene Health 發表在 痞客邦 留言(0) 人氣()

作者:葉佳妤/有勁基因

 

  人類粒線體DNA(mitochondrial DNA; mtDNA)是具有16,569個鹼基的雙股環狀DNA分子,mtDNA基因體中有97%屬於編碼序列 (coding sequence),共囊括了37個基因,其中13個可轉錄轉譯成和氧化、磷酸化有關的蛋白質,負責細胞的有氧呼吸作用,22個可轉錄成轉運RNA (transfer RNA; tRNA) ,2個可轉錄成核糖體RNA (ribosomal RNA; rRNA),一起負責粒線體中的轉譯工作。

 

文章標籤

Yourgene Health 發表在 痞客邦 留言(0) 人氣()

作者:趙宇翔/有勁基因

 

  「您對您的腰圍是否感到不滿意?對頑固的腹部脂肪是否感到棘手?」,生活中我們不難發現這類廣告文宣的身影,它們的重點多半繞著外在美打轉;但事實上,肥胖對「內在」,也就是生理健康的影響更是重要。

 

文章標籤

Yourgene Health 發表在 痞客邦 留言(0) 人氣()

AI軟體產品研發困難的解決之道

作者:張凱迪/有勁基因

 

  沒有三兩三,怎敢上梁山;AI軟體產品經理除了要有能力對機器學習產品開發專案做出正確評估之外,還得將專案接著應用在實際商業用途上。網路媒體VentureBeat曾調查發現,無法順利推出的機器學習產品比例高達8成7。研發專案的達成率要如何才能提升?若能從以下三個面相做出改變,或可幫你達到目的。

文章標籤

Yourgene Health 發表在 痞客邦 留言(0) 人氣()

作者:許柏洋/有勁基因

 

  新冠肺炎疫情延燒,全球確診人數持續攀升;部分國家在短暫解禁後又出現確診高峰的情形。良好的篩檢機制能及早檢出病毒帶原者、加以隔離並防止疫情擴散;特別是在疫苗及治療藥物尚未完備的情況下,建立迅速且準確的篩檢方式,相形之下更是重要。現今新冠病毒的篩檢方式主要有三類:核酸檢測、抗體檢測、及抗原檢測;其中核酸檢測因為準確度較高及偽陰性情況較低等優點而廣為各國採用。

 

文章標籤

Yourgene Health 發表在 痞客邦 留言(0) 人氣()

作者:黃存操/有勁基因

 

  「精準醫療」和一般醫療不同之處,在於精準醫療會根據患者的致病基因變異,來決定該施予病人何種治療方式。因此,精準的基因檢測是實施精準治療的必要前提。

 

文章標籤

Yourgene Health 發表在 痞客邦 留言(0) 人氣()

作者:張益祥/有勁基因

     

  我們在進行總體基因體學(Metagenomics)16S序列分析的時候,常常會為了如何有效運用辛苦實驗所定序出來的序列而絞盡腦汁,還好有不少這個領域的大神們相繼開發出相關演算法來幫忙解決問題,嘉惠眾人。本篇文章就要來介紹針對操作分類單元(Operational taxonomic units; OTUs)叢集分群以及校正擴增子序變異(Amplicon sequence variants; ASVs)錯誤而開發出來的兩種演算方法,順便比較一下之間的差異性。

 

文章標籤

Yourgene Health 發表在 痞客邦 留言(0) 人氣()

作者:鄭翰欽/有勁基因

       

  環境中,各種微生物之間的交互作用其實比人們原本想像的更加複雜;不僅如此,和疾病有關的微生物與其宿主之間的交互作用,目前我們所知的,也只是冰山的一角而已。由於很多疾病和微生物關係匪淺,一直以來都有專家學者投入研究;近年來,環境微生物學更是成了顯學。對第一次踏入環境微生物分析這個研究領域的人來說,如何選擇適合的分析策略是個考驗。若因為對不同分析策略的各種限制不了解,以致選了不適當的策略,就可能事倍功半。本文要介紹給大家的是幾個常見策略的原理與用途,作為大家選擇方案時的判斷參考。

 

文章標籤

Yourgene Health 發表在 痞客邦 留言(0) 人氣()

作者:何胤嫻/有勁基因

 

  「嬰兒猝死症(Sudden infant death syndrome; SIDS)」近年來讓許多父母聞之色變。嬰兒猝死症的定義是:「1歲以下嬰兒突然死亡,在經過完整病理解剖並解析死亡過程、檢視過臨床病史等詳細調查後仍無法找出死因才能以此症判定」1。嬰兒猝死症在2019年衛福部公布的嬰兒死亡原因中位居第七名,在女嬰死亡原因排名更高居第五2。造成嬰兒猝死的確切原因不明,推測可能與遺傳體質、潛在疾病、以及環境因子等多重因素有關。

 

文章標籤

Yourgene Health 發表在 痞客邦 留言(0) 人氣()

作者:洪郁豪/有勁基因

 

    隨著次世代定序(NGS)技術的進步,近年來,基因定序的速度和輸出資料量大大提高。十年前的Genome Analyzer每次能產生的資料量最多只有1 Gb;如今,利用相同核心技術所建構的NovaSeq™6000,兩天內就能產出高達2 Tb的資料量。為了應付這麼大的資料產出量,就得將大量基因庫(library)放進每一輪的定序作業中同時讀取,這項技術稱為「多工處理(multiplexing)」。進入多工處理的所有基因庫在製備時,每條DNA片段上都會先被加入作為標籤(index)用的專一性基因序列,以便能在定序晶片內的單一通道(lane)中塞進大量的混合基因庫去同時進行定序。然而如此一來,經過多工處理後的基因庫定序資料也等於多了一層複雜性,所以在進入後端軟體分析之前,還得先通過一道「多工解訊(demultiplexing)」的步驟,將讀取到的資料先辨識並分門別類好才行。然而,Illumina次世代定序當初在開發基因庫多工處理技術時,曾遭遇標籤錯配(index misassignment)問題的嚴重挑戰;有鑑於此,便在官方白皮書上特別針對這個問題做了詳盡的介紹和因應說明。

 

文章標籤

Yourgene Health 發表在 痞客邦 留言(0) 人氣()

您尚未登入,將以訪客身份留言。亦可以上方服務帳號登入留言

請輸入暱稱 ( 最多顯示 6 個中文字元 )

請輸入標題 ( 最多顯示 9 個中文字元 )

請輸入內容 ( 最多 140 個中文字元 )

請輸入左方認證碼:

看不懂,換張圖

請輸入驗證碼