有勁基因地理位置―汐止總公司

 

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作者:沈淑華/有勁基因

 

古早傳統忽略了求子其實不該只是女方的責任,而是夫妻雙方的責任,因此女性總是背負著傳宗接代的壓力。隨著時代變遷及科技的發達,慢慢地大家的觀念也已經改變,並瞭解到不孕症也有可能會發生在男性身上。男性不孕症的起因可歸類為先天和後天兩大類,本文要介紹大家認識的是屬於先天性不孕症的「克林菲特氏症(Klinefelter′s syndrome; 47XXY)」。

 

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作者:尤冠景/有勁基因

 

單細胞RNA定序(Single cell RNA Sequencing; scRNA-seq)是一種利用高通量定序方法對單一細胞RNA進行擴增與定序的技術,可以幫助微觀、了解和鑑別不同類型的細胞及其基因的表現。單細胞RNA定序的原理是在微流體裝置設置三個通道(如圖一所示),利用流體技術讓細胞先與裂解緩衝液(Lysis buffer)中鑲嵌著DNA primer的微粒(microparticle)會合;當流經含油的通道時,細胞會被油滴一個個隔開,以一個細胞搭配一個微粒的組合形成各自獨立的微滴(droplet);隨後微滴內的細胞迅速被裂解緩衝液分解(cell lysis)並釋出mRNA。微粒上所鑲嵌的DNA primer各自標誌了不同的標籤序列(barcode)以及可用來抓取mRNA的Oligo(dT)序列;當微粒抓取完mRNA後就會打破微滴,進行反轉錄與模版交換,然後進入PCR程序。RNA擴增完成之後,每個細胞的RNA library都會包含不同的標籤序列,定序分析時便可透過這些標籤序列去區分每個細胞的RNA表現狀況。詳細過程如圖一所示1

 

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林修平/有勁基因

 

家裡有毛小孩的爸媽們,你們是否曾為了選擇飼料,看著架上琳瑯滿目的商品傷透腦筋呢?生怕買到製程或衛生有問題的飼料,搞得毛孩們上吐下瀉;尤其毛孩若是天生體質過敏,毛爸毛媽們一定會更仔細審視飼料的成分來源,以免寶貝們吃了發癢東抓西撓,甚至嚴重過敏,弄到得去獸醫院報到。

 

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作者:黃啓銘/有勁基因

 

新型冠狀病毒肺炎(Covid-19)疫情自2020年至今肆虐全球,由於有效的治療藥物及療法未問世,注重個人衛生與疫苗注射仍是目前防範新冠肺炎的黃金標準;然而狡猾的新冠病毒(SARS-CoV-2)仍不斷突變,以致疫苗保護力不如預期。世界衛生組織迄今已經追蹤研究的變異病毒株就有9種1,新冠疫情預期還會持續並演變成人類與病毒的長期攻防戰;該如何有效分配醫療資源使之不致耗竭已然成為新冠疫情防疫的重要課題之一。

 

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作者:葉佳妤/有勁基因

 

目前用來評估中樞神經系統腫瘤的工具有腦脊髓液細胞學、核磁共振以及腦部活檢;但這些工具都各有其限制性例如:腦脊髓液細胞學敏感性不足、核磁共振特異性不佳、以及腦部活檢具侵入性等等,因此需要發展出更好的方法去診斷評估患者中樞神經系統的腫瘤。各種嘗試中,有一項被認為甚具潛力的方法,就是以腦脊髓液(Cerebrospinal Fluid; CSF)中的循環腫瘤DNA(Circulating Tumor DNA; ctDNA)當作生物標記去評估中樞神經系統的腫瘤,這個方法簡稱為CSF-ctDNA分析法。不過,這方面的研究目前仍不多,美國德州Shah研究團隊今年發表的期刊論文1是其中之一;該研究嘗試為中樞神經系統腫瘤的評估尋找更適切的辦法,包括:(1)萃取CSF-ctDNA的最適方法,以及(2)對「CSF-ctDNA內的變異與中樞神經系統腫瘤之間關聯性」進行分析的最佳方法。

 

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作者:張家豪/有勁基因

 

有勁部落格文章《Patterned Flowcell平台的重複讀取問題》中曾提到:HiSeq 4000平台需要尋找文庫(library)的最佳上機濃度進行定序,不然會容易出現資料「重複讀取(duplicate reads)」的情況。那麼有沒有工具可以計算出定序資料中duplicate reads的實際比例並且將之移除呢?答案是:有的。本文會使用表一中的定序資料來為大家介紹兩種可供利用的軟體工具⼀FastQC以及fastp。

 

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作者:趙宇翔/有勁基因

 

台灣疫情在大家努力下雖然逐漸降溫,但秋冬流感好發季節將至,加上新冠病毒突變率高且有無症狀感染者存在,在疫苗覆蓋率仍未達預期的現在,如何提高檢測效率並降低醫療量能損耗,仍是一大考驗。

 

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Written by Tiffany Chen

 

In this day and age, the advances in genetic technologies have allowed us to learn more about our genetic history. Companies such as 23andme and Ancestry claim that they have genetic testing services provided to help people to explore their ancestry and the origins of their traits with a simple way for instance taking a saliva sample. Saliva sampling is the most common method to collect DNA samples, as it provides a significantly higher DNA yield than other sample collecting methods (e.g. buccal swabbing). Once the DNA samples are collected, service providers can proceed genetic testing, and provide customers clues to trace the origins of their facial features and ancestry. Nevertheless, review feedbacks always cite both positively and negatively.

 

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作者:許柏洋/有勁基因

 

      新冠肺炎疫情在全球持續延燒,由於該病毒易變種的特性,不僅疫苗研發,治療藥物設計方面也同樣遭遇瓶頸。不過,賓州州立大學團隊近來利用新冠病毒特性合成出缺陷干擾病毒,這個方法似乎為此疫病的治療打開了另一個希望的大門。1

 

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作者:張益祥/有勁基因

 

      我們在做微生物菌相分析時,經常接觸到兩個名詞⼀微生物相(microbiota)和總體基因體(metagenome),這兩個詞彙時常被大家搞混導致誤用,所以作者很貼心的用以下圖文來解說給大家,如圖一。

 

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