有勁的基因資訊

有勁基因地理位置―汐止總公司

作者：伊喬伶/有勁基因

　　國際癌症研究署(IARC; International Agency for Research on Cancer)於2018年九月公佈了全球罹癌人數統計。截至2018年9月12日，該年的罹癌新病例增至1,810萬人次，癌症死亡案例達960萬件。¹

作者：陳崇斌/有勁基因

Thermo Fisher Scientific認購Yourgene Health股權

合作發展東南亞NIPT市場

作者：邱佩洵／有勁生物科技

《麻省理工科技評論 (MIT Technology Review)》¹每年都會評選出十項當年最具科技性、創新性與突破性的技術，這些技術被認為具備了可深遠影響人們習慣、生活型態甚或產業尖端科技的「未來性」。在2018 年即將畫下句點的此刻，咱們就一起來關注今年上榜的最夯新興科技，看看有哪些是和生物技術有關的吧！

作者：邱佩洵／有勁生物科技

        Laboratory Developed Tests (LDTs；實驗室自行研發檢測試驗) 是一種體外診斷測試，指在特定實驗室內研究發展、設計開發、評估製造，經過小規模驗證測試後，僅限該實驗室使用的檢測方法。在過去，LDTs的需求量小，非作商業用途^1,2。人類基因體圖譜解序完成後，科學家將之運用於臨床醫學，從此得以深入探討人類基因體序列、了解基因與疾病的關聯，以及創新各種臨床檢測方法。為提升臨床檢測服務的效率，各臨床單位的實驗室自行研發出越來越多的檢測項目，經小規模測試後即提供該單位應用。LDTs自此變成發展快速的一個服務項目，也儼然成為臨床實驗室個人化精準醫療的幕後推手。

作者：邱佩洵 /有勁生物科技

你可曾想過，口渴的時候，不是拿起一瓶礦泉水來喝，而是拿出晶片在太陽底下一照，就有乾淨美味可口的水可以喝；是否想過，小小的人造葉片，能夠透過催化劑分解水分子產生氫、氧元素，提供能源。如果這些真的在未來發生，世界會變成怎樣？

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作者：伊喬伶/有勁生物科技

有別於傳統Sanger定序，次世代定序(NGS)因其大量平行、高通量的定序技術，不僅讓效率提升，人類基因體的定序成本也從1,000萬美元降至1,000塊美元；隨著科技日異月新，未來甚至可望降至100塊美元。¹

作者：陳崇斌/有勁生物科技

汰換速率快、生命週期短一直是科技產品的特性。新科技產品的推出，有可能創造出更新或更多的需求─例如：1990年代的傳統電腦產業vs今日的互聯網與社群媒體；但也可能會造成需求萎縮，最有名的例子是子午線輪胎─1946年米其林公司發明耐用度4萬英哩的子午線輪胎，取代了之前每1.2萬英哩就需要汰換的輪胎，子午線輪胎於1970年代開始被廣泛使用，卻造成輪胎需求數量的下降，畢竟人們日常的開車里程數，並不會因為輪胎耐用度提升而增加¹。 （讀到這裡時，大家應該就明白為何今日的科技產品耐用程度普遍不佳了）。需求量能不斷擴增的高度成長市場有其特性，那就是：能在滿足「現有需求」的同時誘導出「更新的需求」；例如：今日的互聯網與社群媒體，其特性就是越多人使用價值越高。如果一個更好更進階的商品，卻僅滿足了「現有需求」，而未能刺激出「更新的需求」，則由於使用人口並沒有成長，市場需求量就會逐漸減少，例如：子午線輪胎。

作者：陳筱琪/有勁生物科技

肥胖是不是病？

這問題過去70年來幾經爭議，近年才逐漸形成共識─世界肥胖症聯盟更在今年3月；將肥胖定義為「慢性、起伏、持續漸進的疾病過程」。肥胖症^a備受重視，無非因為這疾病常環環相扣著一連串併發症─心臟病、高血壓、中風、第二型糖尿病、肝腎損害、代謝症候群、痛風、憂鬱症、阿茲海默症、惡性腫瘤等，幾乎都是耗損大量社會成本的慢性病，其中不少還是60至80歲老人的奪命關鍵¹。

 有勁定序品管從嚴，服務堅持以客為先，

成果發表分享喜悅，未來持續與您相隨！

作者：邱佩洵/ 有勁生物科技

本文接續《次世代定序市場趨勢》上篇，NGS的發展及其運用，以技術層面來說，Targeted Sequencing (TS) 與Whole Exon Sequencing (WES)的應用發展最快，兩者相較，WES稍顯滯礙的主因是該技術在臨床上雖能在成本最精省的情況下獲得最多資訊量，但是卻缺乏統一的臨床生物資訊分析流程、資料庫解讀以及數據管理平台，以至難以取得真正能落實於臨床的資訊。然而值得一提的是，針對罕見疾病，科學家們目前已經整合出一個不錯的資料庫平台 (請參考註一)。此外，我們在上篇文章中已提到，在癌症發生率節節高升的今日，NGS預期在Oncology應用市場上的成長會最快；本文將特別針對腫瘤應用市場進行討論。

作者：邱佩洵/ 有勁生物科技

  2003年人類基因體圖譜解序完成及2007年次世代定序技術 (Next Generation Sequencing，NGS)出現後，科學家自此得以深入探討人類基因體序列、了解基因與疾病的關聯，並將之運用於臨床醫學，創新了基因突變的檢測方法。相較於傳統基因突變檢測，NGS定序檢測對低表現量的基因突變有更高的敏感度，其高通量以及快速的雙重優勢，讓多件樣品與大量基因得以在單次檢測中一次完成，從而促進藥物與個人化治療的發展; 而如今，這些發展業已成為市場趨勢。

 作者：陳崇斌/ 有勁生物科技

     根據GenomeWeb與BBC的報導，2016年11月，英國政府做出一個前瞻性的決議，將非侵入性產前檢查 (NIPT)納入常規的產前檢查中，其檢測範圍包含T13、T18、T21，規劃在3年內全面推廣NIPT，並納入到英國國家衛生服務 (NHS)的體系中。

作者：林志鵬/有勁生物科技

有勁生物科技股份有限公司 (Yourgene Bioscience)，成立於2010年，是台灣一間同時擁有國際認證的基因體核心實驗室與專業生物資訊部門的生技公司。本公司擁有Illumina 及 Ion Torrent 兩大定序平台與相關定序設施，且基因體核心實驗室的定序技術更是獲得Illumina Certified Service Provider與Ion AmpliSeq™ Exome Certified Service之認證，更在2016年底以股權交換和現金，合計720萬英鎊（約合新台幣2.7億元）被英國上市公司Premaitha Health收購。此外，實驗室也獲得了ISO 17025 認證並參加CAP舉辦的能力試驗，擁有最可靠與最標準化之操作定序技術。

作者：邱佩洵/有勁生物科技

英國胎兒基金會 (The Fetal Medicine Foundation，FMF)：由Kypros Nicolaides 教授創立，目的是發展與推廣母體及胎兒醫學，創立至今以不斷突破創新提出嶄新的觀點，成為一個具有公信力的團體。

每年都在不同國家舉辦國際會議的英國胎兒基金會，今年於2016年12/3日-12/4日在英國舉辦。

Ph.D. Program in Bioinformatics

有勁生技網站即將更新改版，除固有『科學研究』服務外，

更提供『基因檢測』與『臨床醫學研究』之服務，

旋毛蟲病（Trichinellosis）是人畜共通的一種飲食性寄生線蟲疾病，有勁生技與澳洲墨爾本大學共同針對此寄生蟲進行產學科研，此項研究成果於2016年二月份發表於學術知名的自然通訊（Nature Communications）期刊，研究內容針對來自14個不同國家（波蘭、挪威、義大利、美國、坦尚尼亞、納米比亞、日本、阿根廷、俄羅斯、哈薩克、美國、澳大利亞、泰國、辛巴威），針對16種不同宿主（包括：豢養豬隻、北極熊、紅狐狸、草原狼、灰熊、疣豬、獅子、貉、美洲豹、浣熊、褐鼠、草原雕、黑禿鷲、斑袋鼬、人類、尼羅鱷）採集其中之旋毛蟲【包含：形成包囊（Encapsulated）與非形成包囊（Non-encapsulated）兩種型態】，利用次世代定序（Next Generation Sequencing，NGS）初步完成16個基因體草圖（Draft genome），學者利用1789個單一拷貝之直系同源基因（Orthologous gene）序列（註：1024個專屬形成包囊類型的旋毛蟲；747個專屬非形成包囊類型的旋毛蟲），進行生物資訊比對分析，初步分類成12個種（Species），且繪製從新生代（Cenozoic era）迄今2100多萬年間之演化親緣關係（Phylogeny），並且進一步追溯這些線蟲的發源之處，構築隨著動物或人的遷徙的生物地理學（Biogeography）分佈圖。