DNA Genotek® OrageneˑDNA ( OG-500 )DNA Collection Kit在臨床上的應用
在實驗室大家應該都有使用過DNA萃取套組 ( DNA isolation ) 的經驗,大部分的DNA萃取套組都需要一定的樣品量或檢體才可以萃取到足夠量的DNA,並且會因樣品取得的難易度及樣品保存的效果而影響後續實驗的結果好壞,倘若萃取出來的DNA品質還要符合生物晶片 ( Microarray ) 或次世代定序 ( Next generation sequencing , NGS )等實驗的樣品要求則難度相對提高許多。
目前 DNA Genotek® 公司推出一款 OrageneˑDNA (OG-500) 樣品保存套組 (DNA Collection Kit ),可藉由此套組將臨床上病人少量的唾液樣品快速保存起來,經測試此套組所保存的樣品在 24°C 及 37°C 測試條件保存五年,發現所萃取的 DNA 片段長度仍可維持在 23Kb 以上,而在 50°C 保存條件下樣品 DNA 至少可以維持 187 天 ( 如表1 )。
經實驗測試 2 ml 唾液樣品藉由 OrageneˑDNA (OG-500) 套組保存搭配 DNA Genotek® prepITˑC2D Genomic DNA MiniPrep 套組所萃取出的 DNA 平均產量為 110 ug ( 62 ug ~ 158 ug ),而樣品的平均含菌量則是低於 11.8% 以下,因此此套組對於應用在醫院病人檢品的收集及少量實驗樣品的保存幫助相當大,和傳統病人檢體的保存方式及萃取量相比都是相當大的改良( 如表1 )。
表1 各種臨床檢體保存方式及DNA萃取品質比較表
臨床上 OrageneˑDNA(OG-500) 套組可以從患者口腔液體中採集到個人或微生物的 DNA 及 RNA,操作流程只需請患者直接將唾液樣品吐入漏斗中,直至樣品液體達到填充線即可將蓋子蓋緊,讓蓋子裡的保存液體與樣本混合約 10 秒鐘即可保存欲進行實驗的樣品,操作上相當簡單方便。之後再搭配 DNA Genotek® 公司 prepITˑC2D Genomic DNA MiniPrep 套組可以更快速萃取出高品質的 DNA,提供給實驗室進行後續實驗之用。
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