有勁的基因資訊

作者：許柏洋/有勁基因

      新冠肺炎疫情在全球持續延燒，由於該病毒易變種的特性，不僅疫苗研發，治療藥物設計方面也同樣遭遇瓶頸。不過，賓州州立大學團隊近來利用新冠病毒特性合成出缺陷干擾病毒，這個方法似乎為此疫病的治療打開了另一個希望的大門。¹

作者：林佑軒/有勁基因

　　循環腫瘤DNA(circulating tumor DNA; ctDNA)是腫瘤組織釋放到血液中的短片段DNA，雖然其確切的生成代謝機制至今仍然不明，但ctDNA的存在可以提供許多和腫瘤相關的訊息，且不需透過侵入性採檢，就能幫助及早發現腫瘤，或者在治療後協助腫瘤復發的監控。ctDNA目前可以提供的訊息究竟有哪些？從下圖一就能一見端倪。

作者：陳泳男/有勁基因

　　自然流產(Miscarriage)的定義是指：懷孕滿24週前的孕期間，因胚胎自發性脫離母體所導致的妊娠中止。如果孕史中曾連續發生兩次或兩次以上的自然流產，流行病學研究將這類型症狀定義為「習慣性流產(Recurrent Miscarriage; Recurrent Pregnancy Loss)」^1、2。習慣性流產對於希望懷孕的夫妻而言，在心理和生理上都會造成莫大的創傷；因此美國生殖醫學會建議孕婦在發生三次流產情形時，就應該進行完整的評估²。

大部分的循環DNA基因突變並非來自於腫瘤

作者：陳崇斌/有勁基因

　　循環DNA(circulating cell-free DNA; cfDNA)在醫學檢測上的應用日趨廣泛，最為人所知的是利用cfDNA去偵測腫瘤突變類型或是進行胎兒發育異常的篩檢(也就是NIPT)。目前在腫瘤液態活檢(tumor liquid biopsy)應用領域開發的重要方向之一就是利用cfDNA去檢測腫瘤；這是因為從cfDNA偵測到的基因突變與腫瘤組織中直接檢測到的基因突變有高度的一致性。不過，由於透過cfDNA偵測到的基因突變有很多並不存在腫瘤組織中，這個問題對cfDNA檢測效果的實際影響，還需要有更多前瞻性的臨床研究來證實或評估。Memorial Sloan Kettering Cancer Center(MSKCC)在前幾年就進行了這樣的前瞻性研究¹，試圖徹底釐清這方面的疑慮。

歐洲腫瘤醫學會(ESMO)的指引與建議

作者：林修平/有勁基因

　　醫療科技日新月異，標靶藥物與免疫療法在今日儼然已是癌症治療的一道曙光，為許多癌症病患帶來希望。然而標靶藥物與免疫療法並不適用於所有病患；醫生必須根據基因突變的生物標記檢測結果，來評估病患是否適用這類治療。次世代定序(Next generation sequencing; NGS)技術，由於能快速檢測大量基因且其成本相對較低，因此目前已被廣泛用於腫瘤的突變基因檢測上，提供醫療人員作為癌症用藥或評估治療方式的參考資訊。

作者：葉佳妤/有勁基因

　　人類粒線體DNA(mitochondrial DNA; mtDNA)是具有16,569個鹼基的雙股環狀DNA分子，mtDNA基因體中有97%屬於編碼序列 (coding sequence)，共囊括了37個基因，其中13個可轉錄轉譯成和氧化、磷酸化有關的蛋白質，負責細胞的有氧呼吸作用，22個可轉錄成轉運RNA (transfer RNA; tRNA) ，2個可轉錄成核糖體RNA (ribosomal RNA; rRNA)，一起負責粒線體中的轉譯工作。

作者：趙宇翔/有勁基因

　　「您對您的腰圍是否感到不滿意？對頑固的腹部脂肪是否感到棘手？」，生活中我們不難發現這類廣告文宣的身影，它們的重點多半繞著外在美打轉；但事實上，肥胖對「內在」，也就是生理健康的影響更是重要。

作者：郭任超／有勁基因

　　冠狀病毒是一類病毒家族，由正股單鏈核醣核酸(+ssRNA)所組成，在很多不同物種的動物身上都可以分離到，有些甚至還能跨越物種壁壘感染人類，引起類感冒症狀的嚴重呼吸道疾病；目前引發全球疫情的新型冠狀病毒(COVID-19)就具有高度傳染性。老年患者和慢性病患者得到新冠肺炎重症的風險尤其高，死亡率也隨著年齡增長而升高。專家推測這個情形似乎和老人及慢性病患者體內能抑制病毒入侵的miRNAs (micro RNAs)數量較少有關^【註1】，因此，打算針對miRNA進行分析以幫助開發治療策略。

作者：林佑軒/有勁基因

　　「罕見疾病」¹，指的是盛行率在萬分之一以下的疾病；這些疾病的患者約有5到7成是兒童，且患者體內經常出現多重器官系統的嚴重異常狀況。依照統計，約有三分之一的罕病兒童無法活過五歲年齡²；而照顧罕病兒童的這段期間，對任何家庭而言都是非常辛苦的，因此多少也會對父母親後續的生育意願造成影響。罕見疾病目前約有8成被認為是基因變異所造成³，基因檢測除了可以幫助找出確切致病的原因、協助醫師選擇適當的治療方式之外，也對病童父母未來的生育計劃有正面的鼓勵作用。

作者：陳崇斌/有勁基因

　　7年前，好萊塢女星安潔莉娜裘莉透過基因檢測發現她身上的BRCA1基因有缺陷，加上其有家族性乳癌遺傳病史，為了降低罹患癌症的風險，她毅然決定對另一側健康乳房、卵巢和輸卵管都一併做了預防性切除；這件事情在當時引起廣泛熱烈的討論，甚至登上了時代雜誌的封面(圖一)，其影響還被冠上「安潔莉娜效應(The Angelina Effect)」這個特別的稱呼。於是，BRCA1/2檢測在當時一躍成為預防醫學與個人化醫療的代名詞，所產生的後續影響至今仍餘波盪漾¹。

作者：林志鵬/有勁基因

場景：辦公室一隅。

人物：部落格總編輯(以下簡稱「編」)、本文作者(以下簡稱「帥」)

作者：沈淑華/有勁基因

　　有勁部落格文章《簡述實務上判斷游離 DNA品質好壞的依據》中曾提到：臨床上可透過「液態活檢」，也就是利用偵測血液中的「生物標記」(biomarker)來進行癌症診斷，達到癌症精準醫學預測和預防的目標。近年來已有不少研究採用癌症患者液態活組織內的血液標記做為觀察對象，例如血液循環腫瘤DNA(ctDNA)與游離DNA(cfDNA)。本篇文章要介紹的是另一種生物標記─腫瘤突變負荷量(tumor mutation burden; TMB)。

作者：陳正鑫／有勁基因

　　羨慕大胃王怎麼吃都吃不胖的體質嗎？或許未來的你也有機會加入他們的行列。這裡賣個關子，我們先一起來看看骨關節炎研究能為大胃王帶來什麼啟示吧！

作者：尤冠景/有勁基因

    男女生來有別，近年興起的兩性醫學就特別主張應針對男女生理上的差異給予不同的治療；免疫系統就是其中一個常被拿出來研究討論的「生理上的差異」。

作者：陳泳男/有勁基因

　　根據臺灣的統計，國內已婚夫婦約一成到一成五有不孕症方面的問題，而不孕的原因則約半數和男性因子有關(如精蟲數量太少等)。根據研究文獻，性染色體的非整倍性(sex chromosome aneuploidy)和Y染色體特定區域的微缺失(microdeletion)是導致男性不孕症的原因之一^{1 2 3 4 5}。

作者：徐嘉妤/有勁基因

　　人體內的微生物對人類健康和疾病影響很大。大家都知道人體內大部分微生物的棲息地是在腸道，因此相關研究至今為止主要也都在分析腸道內的微生物菌相。不過近來也有越來越多研究主題聚焦在人體腫瘤組織及血液中的微生物上。2020年3月的Nature期刊就有一篇論文¹是利用美國癌症基因體圖譜計畫TCGA(The Cancer Genome Atlas)資料庫中來自患者的腫瘤組織、腫瘤周圍組織及血液樣本的全基因體(WGS)和轉錄體(RNA-seq)定序資料²去進行分析研究。

作者：趙宇翔/有勁基因

新生兒溶血症(Hemolytic disease of the fetus and newborn, HDN)

    孕婦和胎兒的血型不合時，由於胎盤的阻隔保護，一般是不會造成問題的；但如果母體因某些原因接觸到不同血型抗原，誘導產生的IgG抗體再通過胎盤進入胎兒體內結合紅血球上的對應抗原，就會引發胎兒的免疫反應，造成溶血，這就是所謂的「新生兒溶血症」；輕者產生貧血、黃疸等症狀，尚可透過光照或是其他積極治療去控制病情，重者則有終身神經系統損壞的後遺症，甚至會危及胎兒性命。

作者：伊喬伶/有勁基因  （有勁基因講座報導系列─游舒涵醫師講座）

案例（二）多次侏儒症胎兒的懷胎病史

作者：黃存操/有勁基因

　　癌症，泛指有「細胞異常增長」特徵的這類疾病。細胞要異常增長，必須得突破正常細胞在生長、複製與遷移上的諸多限制才能做到。除了細胞的異常增長，不同癌症在細胞層次上其實也有著非常不同的特性，此稱之為癌細胞的異質性(heterogeneity)。

作者：伊喬伶/有勁基因  （有勁基因講座報導系列─游舒涵醫師講座）

案例（一）近親生育與胎兒結構異常