NGS不僅可以協助物種解序更可以幫助癌症研究與臨床應用,就如下圖所顯示的有RNA-seq與ChIP- seq …..等等,提供更多訊息來瞭解cancer genome與設計出個人化的治療。
在癌症研究方面,在過去幾年中,NGS對於癌症研究不只扮演提供新的遺傳變異的角色,更得到癌症生成與轉移的複雜性之瞭解。使用NGS做研究的癌症種類有乳癌與直腸癌 .....等等。如下表
在臨床應用方面,NGS已經被應用在許多方面,包括產前診斷、病原體檢測以及基因突變甚至更多。雖然臨床應用中已有Sanger sequencing、PCR與microarray技術來確認genetic mutation,但這3種技術卻有NGS沒有的缺點。例如:microarray可發現single nucleotide variants(SNVs),但若要確認larger DNA aberration是有困難度在,就拿在癌症中常見的結構重組則非由microarray可確認,相較之下,whole genome sequencing與whole exome可以提供在臨床上DNA aberration 、基因重組或其他突變當作參考,因此NGS可以為診斷工具的其中之一及協助臨床上每個病人獨特性的治療。自2010年來臨床使用NGS技術來輔助疾病的發現是越來越多,如下表
參考文獻:
Next generation sequencing in cancer research and clinical application,Shyr D, Liu Q. Biological Procedures Online 2013, 15:4