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真核生物rRNA包含28S、18S、5.8S、5S四種rRNA，一般在判斷RNA是否有降解時，會去觀察28S與18S rRNA的狀況，在RNA品質佳的狀態下，28S rRNA總量應為18S rRNA的兩倍左右，如下圖分別為哺乳動物的RNA proflie，

植物的RNA可以觀察到除了最明顯的28S與18S rRNA外，還會有其他peak的存在，這是因為來自葉綠體的rRNA造成的現象，如下圖所示。

若是降解的RNA則會出現28S與18S比值小於1的情況，並且可以觀察到在18S rRNA的下方有出現許多降解的RNA片段，如下圖：

以上是我們一般所知的~

故事是這樣的，有一天我們將果蠅的RNA進行電泳分析，卻觀察不到28S rRNA的存在，如下圖為果蠅的RNA profile：

我們第一次看到這個現象時，覺得很納悶，懷疑是否是RNA有降解的現象造成，

然而，18S rRNA下方卻沒有觀察到降解RNA的片段，請教過一些做果蠅的老師，他們說果蠅的RNA本來就只有一條band，上圖的RNA呈現的品質很好。聽完答案後，雖然，可以為RNA品質的問題感到放心，然而，心中的疑惑反而加深，難道，果蠅就只有18S rRNA存在嗎？若沒有28S rRNA，核醣體結構將不完整，是如何進行蛋白質的製造？

直到看到Winnebeck團隊撰寫的 ”Why dose insect RNA look degraded? ”這篇論文，才解開心中的疑惑；Winnebeck團隊在蜜蜂的RNA上，觀察到一個有趣的現象，加熱會影響RNA profile，若RNA經過70℃，2分鐘中處理後再進行電泳分析，則會發現RNA只有單一條band的存在，只有觀察到18S rRNA的存在，如下圖A；若沒有經過加熱處理，直接進行電泳分析，RNA profile會有兩條band，就像一般哺乳動物RNA profile，如下圖B，原本消失的28S rRNA便會出現。

這樣的現象不只出現在蜜蜂果蠅等昆蟲，也出現在某些軟體動物上，這牽涉到rRNA成熟過程中的機制，這背後的原理比我們想像中的要複雜許多，不是所有的生物的rRNA profile皆相同，至少在size上就存在差異，因此在判斷RNA品質時，無法單純以28S/18S rRNA比值來判定。Winnebeck團隊在論文中有提到，原來蜜蜂28S rRNA在成熟之前，會被切成兩段，長度都在1.9左右 (這樣的長度與18S rRNA的長度相當)，一段為28S rRNAα、另一段為28S rRNAβ，見上圖圖C，而這兩段rRNA會靠著氫鍵的作用力而黏合在一起，執行著28S rRNA的功能，由於只是藉由氫鍵彼此黏合，因此，在經過加熱後，28S rRNAα與28S rRNAβ就會被分開，因此，在電泳圖上只會觀察到1.9k nt左右觀察到一條band，這一條band就是28S rRNAα、28S rRNAβ與18S rRNA疊合在一起所行成的，所以28S rRNA並沒有消失。

以上是我們目前能理解的，以及找到消失28S rRNA原因。