在實驗過程中多多少少會遇到一些問題，例如有兩個分別貼上DNA及RNA標籤的樣品，在實驗過程中標籤都掉了此時該如何分辨？
也許分辨的方法不只一種，但其中一種是可以利用溶液PH值的酸鹼來辨別，首先將兩管樣品分別取出一些加入鹼性溶液中，再去跑膠則就可以判斷出哪一個為RNA。
RNA在鹼性環境下會有不穩定的現象，甚至會產生降解的情況，其原因是RNA 2號碳上的OH基會受到鹼性溶液(OH-)攻擊，而則造成phosphodiester bond 遭破壞而斷裂行成2’，3’-cyclic monophosphate derivative(如下圖)，所以在分子生物中PH值是很重要的介面之一。
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