N50是一個用來評估de novo assembly效果好壞的方法之一。當我們把contigscaffold從大到小排列後,從最大的contig開始進行長度的累加,當累加長度達到全部contigscaffold總長度的50%時,這時所加上的contigscaffold長度,即為N50。如下圖所示:

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而N50的50,即為50%的意思。同理,N25即代表25%;N75即代表75%。數字越大,則評估條件越嚴苛。

 


 

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